Новым Положением о государственной экологическом мониторинге уникальной экологической системы озера Байкал изменен
порядок его проведения в части ответственного лица: если ранее мониторинг проводился уполномоченными Правительством федеральными органами исполнительной власти, то теперь это полномочие перешло к Правительству РФ
Госэкомониторинг озера Байкал будет осуществляться Минприроды России, Минсельхозом России, Росводресурсами, Росгидрометом, Роснедрами, Росрыболовством, Рослесхозом, Росреестром и органами исполнительной власти Забайкальского края, Республики Бурятия и Иркутской области в соответствии с их компетенцией.
Одновременно с этим, мониторинг будет осуществляться при участии специализированной рабочей группы при Минприроды России, которая создана для сопровождения работ по интеграции данных различных видов экологического мониторинга в рамках единой системы госэкомониторинга озера Байкал и комплексной оценки состояния озера Байкал.